EMSA PAGE预制胶是一种使用安全、便捷、高品质的常规尺寸聚丙烯酰胺预制凝胶,适用于EMSA实验。本预制胶有1.5厘米高的浓缩胶(4%),具有非常优良的分离效果,电泳后条带平整、清晰、细腻、锐利,几乎没有边缘效应;同时本预制胶胶板为玻璃材质,减少了对蛋白的非特异性吸附,电泳效果非常好,达到甚至超过了自配EMSA PAGE胶的电泳效果。
BoGel EMSA PAGE预制胶使用略偏碱性pH的TBE缓冲液制备。本预制胶使用常用的0.5×TBE电泳液,推荐使用百奥莱博1×TBE缓冲液、5×TBE缓冲液以及5×TBE,或参考使用说明自行配制相应的电泳液。
Acr∶Bis | 29∶1 |
加样孔数 | 15孔 |
最大上样量 | 30μL |
预制胶浓度 | 6% |
胶板尺寸 | 98×84×4.1mm(宽×高×厚) |
凝胶尺寸 | 81×74×1.5mm(宽×高×厚) |
组分 | 规格 |
EMSA PAGE预制胶(6%,15孔) | 10块 |
说明书 | 1份 |
保存:2~8℃,有效期1~2个月,切勿冷冻。
BoGel EMSA PAGE预制胶有10孔和15孔两种孔数,4%和6%两种不同浓度的固定浓度胶可供选择,每种预制胶的参数请参考下表:
货号 | 预制胶浓度 | 孔数 | 最大上样量 | 电泳缓冲液体系 |
YTC0181/YTC0182 | 4% | 10/15 | 60/30μL | 0.5×TBE |
YTC0185/YTC0186 | 6% | 10/15 | 60/30μL | 0.5×TBE |
- 本制品使用安全、便捷。本预制胶无需配制,即开即用,去掉梳子即可上样,而传统的EMSA PAGE配制凝胶繁琐费时,并且制胶时还会接触有毒和刺激性试剂。
- 本制品质量稳定。本预制胶采用高品质玻璃胶板,和塑料胶板相比,大大减少了胶板对蛋白的吸附,电泳效果更好。本制品流水线灌注,品质稳定可靠,重复性好,不同批次的产品一致性高。
- 本制品电泳效果好。本预制胶的蛋白质-核酸复合物分离效果极佳,非常适合低丰度蛋白的检测。
- 本制品电泳槽兼容性好。本预制胶兼容市场上主流的小型电泳槽,如Bio-Rad公司的Mini-PROTEAN Tetra Cell电泳槽、Life公司的XCell SureLock Mini-Cell电泳槽(需与百奥莱博提供的特制挡板配合使用)、以及上海天能、北京六一等的mini胶电泳槽或其它胶板宽度在10厘米的电泳槽。
- 本制品电泳时间短。本预制胶最快30分钟即可完成电泳,推荐的电泳电压和电泳时间为100V 30~90分钟,即可完成电泳并获得非常平整和锐利的电泳条带。具体的电泳时间取决于凝胶浓度。
- 本制品取出凝胶极为便捷。只需用刀片在玻璃胶板一侧轻轻划一下即可,并且玻璃胶板打开极为方便,无需特殊的起撬工具。
凝胶迁移实验是一种用于蛋白与核酸相互作用的技术。最初是用于转录因子与启动子相互作用的验证性实验,也可应用于蛋白-DNA、蛋白-RNA相互作用研究。EMSA技术基于进行非变性聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶电泳时,蛋白质-DNA复合物的迁移速度比游离线性DNA片段慢,从而导致DNA迁移率在与蛋白质结合时减慢。EMSA分辨蛋白质-DNA复合物的能力在很大程度上取决于复合物在实验步骤中的稳定性。电泳缓冲液相对较低的离子强度有助于稳定瞬时相互作用,可以通过该方法分析不稳定的复合物。此外,EMSA也可以解决某些蛋白质因子结合导致的DNA构象改变或弯曲。EMSA不局限于蛋白质与DNA的相互作用,也可用于蛋白质-RNA和蛋白质-蛋白质的相互作用的研究。
EMSA作为研究基因调控和确定蛋白质-DNA相互作用的一项重要技术有如下优点。DNA结合蛋白的来源可以是细胞核或全细胞提取物、体外翻译产物或分离纯化的蛋白;可以定性地用于鉴定裂解物中的序列特异性DNA结合蛋白(如转录因子),并结合相应DNA序列上的点突变来鉴定特定基因上游调控区内的重要结合序列;还可用于定量测量热力学和动力学参数。
- 由于本预制胶保质期较短,需新鲜制备,在您确认订购后约5个工作日才能发货。
- 本预制胶不能置于0℃以下冷冻,否则凝胶会冻裂。
- 电泳液建议新鲜配制。试剂纯度不够、反复使用或长期放置的缓冲液会降低电泳效果。电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲性能下降,可能使电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。
- 本预制胶为了兼容几乎所有厂家的小型凝胶电泳槽,所以改进了与电泳槽U型硅橡胶密封条的吻合结构(如Bio-Rad等公司的电泳槽)。建议在电泳时须将具有突起结构的U型硅橡胶密封条取出后反过来安装,使其没有突起的平滑面朝外,从而防止漏液,见下图。一般内槽电泳液加满,外槽电泳液没过电泳槽底部的阳极即可,并且电泳结束后的电泳缓冲液可以作为外槽缓冲液重复使用1~2次。另外,部分公司都已经配套无突起结构的U型硅橡胶密封条,使用这样的U型硅橡胶密封条就不会出现内外槽之间的漏液现象。
图1.Bio-Rad等公司的电泳槽U型硅橡胶密封条的突起结构图。由于百奥莱博的BoGel PAGE预制胶的该部位是平的,使其兼容几乎所有厂家的小型胶电泳槽,所以电泳时须将具有突起结构的硅橡胶密封条(左图)取出后反过来安装(右图),使其没有突起的平滑面朝外,从而防止漏液。 - 由于BoGel PAGE预制胶比Life公司的XCell SureLock Mini-Cell电泳槽配套的NuPAGE Gel或Novex Mini Gel略薄,所以需加特制挡板配合使用。如有需要,请在订购本制品时告知,百奥莱博会免费赠送该特制挡板。
- 样品准备:可参考EMSA试剂盒、生物素标记EMSA探针检测试剂盒。上样缓冲液推荐使用EMSA上样缓冲液。
- 预制胶、电泳液的准备:
- 上样:将10μL吸头的尖端垂直方向轻轻插入到上样孔中即可上样,吸头避免戳破凝胶,更不能使胶板变形导致样品泄漏。
- 最佳上样量须通过实验来确定,样品过量较易导致条带拖尾和信号过强。
- 将电泳槽盖子盖好,并将电源线插头插入电泳仪电源插孔(红对红,黑对黑)。一般在100V电压,电泳30~90分钟左右即可,电泳至EMSA/Gel-Shift上样缓冲液中的蓝色染料溴酚蓝至胶的下缘1/4处,停止电泳,切勿使探针跑出凝胶。实际电泳时间与电泳液质量、凝胶的浓度和数量等因素有关系,需自行适当调整。
- 取出玻璃胶板,将刀片从玻璃胶板一侧轻轻划一下,稍加用力慢慢扳开或用刮板轻轻撬开玻璃胶板,用刮板将凝胶取出。
- 后续实验步骤可参考EMSA试剂盒或生物素标记EMSA探针检测试剂盒。
- 电泳示踪染料溴酚蓝扭曲、电泳条带大幅扭曲、电泳时间大幅度延长:
可能原因是内槽缓冲液泄漏而导致。建议重新夹一下胶板,防止在电泳过程中内槽液面逐步降低。 - 使用自己配制的电泳缓冲液与上样缓冲液电泳后条带较模糊:
本预制胶pH为略偏碱性,缓冲液配制不当,或长期放置变质,都会对本预制胶的电泳效果产生影响。推荐使用1×TBE缓冲液、5×TBE缓冲液以及5×TBE。 - 在上样时不可将吸头过度插入上样孔中,吸头的过度插入会使胶板变形,导致样品泄漏。
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